2）如有在先申请的相同或近似商标在查询时还未进入商标局数据库，因两者时间相近会使查询结果无法反映；

3）如查询报告提供了几个可能构成近似的商标，代理人只是通过一般审查标准和经验来做出分析，其意见仅供参考，并不能代表商标局的审查意见；

4）对于组合商标，如仅查询了商标的一部分（如中文或英文），而实际申请商标中的其它部分（如图形）与他人的注册商标相同或近似也会导致商标整体被驳回；

5）委托人在查询时仅提供了商标的名称，但实际申请时所提供的商标设计稿中由于字体、色彩、结构或排列的差异，也会导致查询结果不能完全反映相同或近似的程度。