气相分子吸收光谱仪广泛应用于饮用水生产、环境监测、石油化工、卫生、食品工业、土壤、化学肥料、化学试剂、造纸、皮革、印染、工矿企业、土木建筑、海洋与渔业和水文监测等各种领域的水质分析。气相分子吸收光谱仪是应用气相分子吸收光谱法进行水质分析的一种仪器，目前有氨氮（HJ/T195-2005）、凯氏氮（HJ/T196-2005）、亚硝酸盐氮（HJ/T197-2005）、硝酸盐氮（HJ/T198-2005）、总氮（HJ/T199-2005）、硫化物（HJ/T200-2005）6个符合环保部标准方法的测定项目。汞（HJ597 -2011）冷原子吸收法测定以及亚硫酸盐、高锰酸钾指数（CODMn）、氯离子、溴离子、碘离子、二氧化硫、二氧化氮等多种指标可以采用文献方法进行气相分子吸收光谱检测。