栽植小叶黄杨苗水量不可过大或过小，水量过大，土壤变软，苗木容易倒伏；水量过小，影响成活。栽植苗经灌水或较多的降雨后，苗木易倒伏、倾斜或露根，如发生此类现象，应立即扶直、培土、踩实，否则由于苗木正在发芽生长，几天之内苗干就会变弯。
幼苗时期，苗木组织幼嫩，加之栽种时间不长，植株根系不很发达，扎根不深，此时苗木抗逆性不强。苗期保护工作十分重要。在生产中必须采取正确的栽培技术，促使苗木生长健壮，增强抗性，为苗木创造出不利于灾害性因子发生发展的环境条件，这样才能提高苗木的产量和质量。
当年栽植的小苗一次浇透水后可任其自然生长，视墒情每15天灌水一次，结合中耕除草每年春、秋两季适当追肥1～2次，一般施以氮肥为主的稀薄液肥。小叶黄杨每年发芽长枝多次，极耐修剪。夏季要整形修剪一次，秋季可根据不同的绿化需求进行平剪或修剪成球形、圆锥形，并适当疏枝，保持一定的冠形枝态。冬季比较寒冷的地方可采取堆土防寒等措施。小叶黄杨繁育一般以扦插为主，多在5～6月进行。可先从树冠中上部斜剪，取5～10厘米长、生长旺盛的侧枝剪除下部小叶，上部叶片全部保留。然后用生根粉处理，剪口向下扦插于苗床内。苗床地宜选择在通风、耐阴之处，亦可遮阳扦插，成活率极高。