微量高压反渗透系统的基本工作原理是：
运用特制的高压水泵，将原水加至6—20公斤压力，使原水在压力的作用下渗透过孔径只有0.0001微米的反渗透膜。只允许体积小于0.0001微米的水分子和溶剂通过。
保安过滤器内装有过滤孔径为5μm的滤芯。这些滤芯会过滤掉任何尺寸大于5μm的颗粒。对下游RO膜起到保护作用，否则RO膜表面极易结垢。较常用的渗透膜类别为polyamide membrane，膜型式为卷式复合膜，该种型式的膜的除盐率可达99.5%。
由于RO膜易受水中PH值、余氯及水温的影响，故RO膜运行前对进水水质有严格要求：
PH值：3~10
余氯值：<0.1mg/L
SDI15值：<5.0
水温：<45 ℃
以上的任一指标超出范围，均有可能使渗透膜产生变形，从而影响出水水质和缩短膜的使用寿命。并且膜的种类不同对进水水质要求也有所不同。在调试前可以根据RO膜厂家提供的说明进行确认。
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