Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Seq、ChIP-Seq等数据进行联合分析，从基因调控网络和表观遗传网络来阐述生物体性状形成的相关机制。

图1. 染色体三维结构图

技术优势
1、无需专门构建群体，单个样本实现辅助基因组组装； 
2、**率高，人类基因组锚定染色体**率为98%，排序和定； 
3、**，性价比高。

技术流程
1、用甲醛对细胞进行固定，使DNA与蛋白，蛋白与蛋白之间进行交联；
2、进行酶切（如Hind III等限制性内切酶），使交联两侧产生粘性末端；
3、末端修复，引入生物素标记，连接；
4、解交联，使DNA和蛋白、蛋白和蛋白分开，提取DNA，打断，捕获带有生物素标记片段，进行建库；
5、测序。

图2. Hi-C实验流程

生物信息学分析流程

辅助基因组组装流程图


应用领域


送样要求
1、细胞交联
2.5×106细胞量满足一个标准Hi-C文库，建议培养5×107至1×108，保证实验可重复性

2、组织DNA
提供组织DNA量为15-20ug

3、运输方式
足量干冰运输