厦门港是我国东南沿海重要的天然深水良港，港阔水深，终年不冻，自然条件优越。厦门港交通发达，拥有便捷的航运网络。铁路运输有鹰厦铁路为干线，省内与外福线、漳龙线、漳泉等铁路支线连接。国际航运已遍及全球各主要港口，水运航运可通我国沿海、内河、长江沿线、珠江三角洲、环渤海湾等全国港口。厦门东南国际航运中心，是继上海、天津、大连之后国家明确支持建设的第四个国际性航运中心。形成以国际贸易中心、金融中心、经济中心为依托的国际航运枢纽、国际化港口，到2015年，厦门东南国际航运中心的全港货物吞吐量预计达2.3亿吨，集装箱吞吐量力争1000万标箱。到2020年，吞吐量达到3亿吨，集装箱吞吐量达1500万标箱。